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방글라데시의 가금류 농장 및 살아있는 조류 시장에서 조류 인플루엔자 A 바이러스 H5N1 및 H3N8 아형의 역학 및 분자 특성 분석
Scientific Reports 13권, 기사 번호: 7912(2023) 이 기사 인용
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조류 인플루엔자 바이러스(AIV)는 여전히 세계적인 위협으로 남아 있으며, 물새는 바이러스가 다른 숙주로 확산되는 주요 저장소 역할을 합니다. 고병원성 조류 인플루엔자(HPAI) H5 바이러스는 계속해서 가금류 산업에 엄청난 위협이 되고 있으며 인간에게도 초기 위협이 되고 있습니다. 가금류에서 AIV의 유병률과 하위 유형(H3, H5 및 H9)을 추정하고 AIV 하위 유형 H5N1 및 H3N8의 기본 위험 요소 및 계통발생 분석을 식별하기 위해 단면 연구가 방글라데시의 7개 지역에서 수행되었습니다. 배설강 및 구인두 면봉 샘플은 살아있는 조류 시장(LBM) 및 가금류 농장의 새 500마리로부터 수집되었습니다. 각 새는 배설강 및 구인두 면봉 채취를 통해 표본을 채취했으며, 추가 분석을 위해 면봉을 모았습니다. 풀링된 샘플을 인플루엔자 A 바이러스(IAV) 매트릭스(M) 유전자에 대해 분석한 후 실시간 역전사 중합효소 연쇄 반응(rRT-PCR)을 사용하여 H5 및 H9 분자 하위 유형을 분석했습니다. 비H5 및 비H9 인플루엔자 A 바이러스 양성 샘플의 서열을 분석하여 가능한 하위 유형을 식별했습니다. 선택된 H5 양성 샘플을 헤마글루티닌(HA) 및 뉴라미니다제(NA) 유전자 서열분석에 적용했습니다. 위험 요인 분석에는 다변량 로지스틱 회귀 분석이 사용되었습니다. IAV M 유전자 유병률은 40.20%(95% CI 35.98~44.57)였으며, 닭, 물새, 칠면조에서는 각각 52.38%, 46.96%, 31.11%가 검출되었습니다. H5, H3, H9의 유병률은 각각 22%, 3.4%, 6.9%에 달했습니다. 물새는 닭에 비해 AIV(AOR: 4.75) 및 H5(AOR: 5.71)에 걸릴 위험이 더 높았습니다. 여름철보다 겨울철에 바이러스가 더 많이 발견되었습니다(AOR: 4.93). 죽은 새는 건강한 새보다 AIV 및 H5 검출 위험이 더 높았으며 LBM에서는 H5 검출 확률이 증가했습니다. 서열 분석된 6개의 H5N1 바이러스는 모두 2015년부터 방글라데시의 가금류와 야생 조류에서 순환하는 계통군 2.3.2.1a-R1 바이러스였습니다. 우리 연구에서 12개의 H3N8 바이러스는 방글라데시의 이전 H3N8 바이러스보다 몽골과 중국의 야생 조류의 인플루엔자 바이러스와 더 유사한 두 개의 유전 그룹을 형성했습니다. 이 연구 결과는 AIV 통제 및 예방에 대한 지침을 수정하여 확산에 영향을 미치는 확인된 위험 요인을 설명하는 데 사용될 수 있습니다.
Influenza A virus is a negative-strand RNA virus belonging to Orthomyxoviridae family, and the virion carries surface proteins known as hemagglutinin (HA) and neuraminidase (NA)1. Based on their potential to cause disease in chickens, avian influenza viruses (AIVs) are grouped into two categories: highly pathogenic avian influenza virus (HPAIV) and low pathogenic avian influenza virus (LPAIV)2,3,4. AIVs infect chickens, turkeys, and other gallinaceous birds and inflict significant economic losses worldwide5,6,7. In terms of humans and poultry, Bangladesh is one of the world's most densely populated countries. The poultry industry in Bangladesh supports economic growth and poverty reduction in rural and urban areas by creating employment opportunities and food products8. LPAIVs and HPAIVs, including the highly pathogenic H5N1 viruses, have been found in waterfowl, pet birds, wild birds, and chickens in Bangladesh9,10,11,12,13. In Bangladesh, over 580 outbreaks of HPAI H5N1 have been reported in poultry and wild birds since 200714,15,16. Because the poultry industry accounts for 20% of the livestock sector in Bangladesh, the culling of an estimated 250 million diseased animals to date in response to these outbreaks causes food insecurity and negatively impacted the economic growth17. In addition, eight human cases of H5N1 have been reported in Bangladesh, with one fatality (2020)." href="/articles/s41598-023-33814-8#ref-CR18" id="ref-link-section-d20661986e656"> 18. 인간 H5N1 감염은 베트남, 태국, 인도네시아, 홍콩, 중국 및 캄보디아에서 보고되었으며, 이들 모두 LBM과 상업 및 방목 농장에서 가금류에 노출된 이력이 있으며, 이는 LBM과 농장 모두 기여할 수 있음을 의미합니다. 가금류 사이 및 가금류에서 인간으로의 AIV 확산19,20,21,22. 더욱이 LPAIV의 공동유통도 우려된다.